Advanced Pathway Painter dient zur Visualisierung von Pathways verschiedener Formate wie z.B.: KEGG, BioCarta oder GenMAPP und bietet die Möglichkeit quantitative Daten aus Gen- bzw. Protein-Experimenten direkt mit den angezeigten Pathways zu verbinden. Dabei werden die jeweiligen Werte in die Pathways eingezeichnet. Die Verknüpfung erfolgt über die Gen- oder Protein-Namen bzw. über die jeweilige Accession-Nummer. Darüber hinaus besteht die Möglichkeit einer umfangreichen Informationsgewinnung durch eine vorhandene Internetverlinkung zu den interessierenden Internetdatenbanken.

Es handelt sich bei Advanced Pathway Painter um einen Teilbereich der kommerziellen Anwendung GENOM.