Diff Commander ist ein Tool mit dem die Inhalte von Verzeichnissen verglichen und synchronisiert werden können. Die Verzeichnisse werden in zwei übersichtlichen Baumstrukturen angezeigt. Auch bei komplexen rekursiven Vergleichen geht durch die farbliche Hervorhebung der Überblick nicht verloren. Durch Dateimasken und detailierte Regeln ist es an praktisch alle Anforderungen auch komplexester Sychronisationen anzupassen. Neben Dateimasken ist auch ein Filtern nach Datum, Uhrzeit, Attributen und anderen Kriterien möglich. Die Regeln zur Synchronization können als Vorlagen gespeichert und zum Abgleich von einzelnen Dateien, Verzeichnissen oder ganzen Bäumen genutzt werden. Von bidirektionaler Synchronization bis zum einfachen Backup kann damit alles realisiert werden.